RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 TNRQ92752 1358 aa29.98■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.96■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.96■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 COG6Q9Y2V7 657 aa29.95■■■□□ 2.39
EHD4-202ENST00000569223 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.95■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 TECPR2O15040 1411 aa29.94■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 CPS1P31327 1500 aa29.93■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.93■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.93■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.93■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.92■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.92■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 SIRT1Q96EB6 747 aa29.9■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 IGHDP01880 384 aa29.89■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.89■■■□□ 2.38
EHD4-202ENST00000569223 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.89■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.88■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.88■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 POLKQ9UBT6 870 aa29.88■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 IL16Q14005 1332 aa29.86■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 TNNQ9UQP3 1299 aa29.86■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 RLBP1P12271 317 aa29.86■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 AAMPQ13685 434 aa29.85■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 AKAP12Q02952 1782 aa29.85■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 FAM161AQ3B820 660 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 FBLN1P23142 703 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 RGS3P49796 1198 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 RIPK4P57078 832 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 FCHSD2O94868 740 aa29.83■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 ITSN1Q15811 1721 aa29.83■■■□□ 2.37
EHD4-202ENST00000569223 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 C8orf34Q49A92 452 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.81■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 NME9Q86XW9 330 aa29.81■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 C3P01024 1663 aa29.79■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.79■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.78■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.77■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.77■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.76■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 PRKAR2BP31323 418 aa29.76■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.76■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.76■■■□□ 2.36
EHD4-202ENST00000569223 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.76■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.75■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.72■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 IL13P35225 146 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 COG3Q96JB2 828 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 LTKP29376 864 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD4-202ENST00000569223 NEFMP07197 916 aa29.7■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 HMOX1P09601 288 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 NFE2L2Q16236 605 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.67■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 NBR1Q14596 966 aa29.67■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 TRIM27P14373 513 aa29.66■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
EHD4-202ENST00000569223 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.64■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 PTPRUQ92729 1446 aa29.63■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 SLIT1O75093 1534 aa29.61■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 KIF16BQ96L93 1317 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD4-202ENST00000569223 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms