RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.33■■□□□ 1.17
MEIS3-211ENST00000561204 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.33■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.33■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 CABP1Q9NZU7 370 aa22.32■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 DIP2BQ9P265 1576 aa22.32■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 REREQ9P2R6 1566 aa22.32■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.32■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.31■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 AGLP35573 1532 aa22.3■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.3■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 USP19O94966 1318 aa22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 TSPOAP1O95153 1857 aa22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 DLC1Q96QB1 1528 aa22.29■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.28■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.27■■□□□ 1.16
MEIS3-211ENST00000561204 IL16Q14005 1332 aa22.26■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 SEC24BO95487 1268 aa22.26■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.26■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RIPK4P57078 832 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.24■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 ATP7BP35670 1465 aa22.23■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 ZMYM3Q14202 1370 aa22.23■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 TRIM27P14373 513 aa22.22■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.22■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 FBLN1P23142 703 aa22.21■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 NFKBIBQ15653 356 aa22.21■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 POLKQ9UBT6 870 aa22.21■■□□□ 1.15
MEIS3-211ENST00000561204 FCHSD2O94868 740 aa22.2■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.19■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.19■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.19■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.18■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 MLECQ14165 292 aa22.18■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 PRKAR2BP31323 418 aa22.16■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.15■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.15■■□□□ 1.14
MEIS3-211ENST00000561204 METP08581 1390 aa22.15■■□□□ 1.14
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MEIS3-211ENST00000561204 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.13■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.12■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.12■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.12■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 KIF16BQ96L93 1317 aa22.11■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 NME9Q86XW9 330 aa22.11■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 HMOX1P09601 288 aa22.11■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.11■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.1■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 NFE2L2Q16236 605 aa22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 IL13P35225 146 aa22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.09■■□□□ 1.13
MEIS3-211ENST00000561204 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 SMC5Q8IY18 1101 aa22.07■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.07■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.07■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.07■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 CPS1P31327 1500 aa22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 TECPR2O15040 1411 aa22.06■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 BECN1Q14457 450 aa22.05■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF428Q96B54 188 aa22.05■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 GSE1Q14687 1217 aa22.04■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 SIRT1Q96EB6 747 aa22.04■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.04■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 VAMP4O75379 141 aa22.02■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 AKAP12Q02952 1782 aa22.02■■□□□ 1.12
MEIS3-211ENST00000561204 COG3Q96JB2 828 aa22.02■■□□□ 1.12
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