RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 TMC1Q8TDI8 760 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 USP6P35125 1406 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 ABTB2Q8N961 1025 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 LRP6O75581 1613 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13□□□□□ -0.33
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CS-224ENST00000551155 ABCA3Q99758 1704 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 ADAMTS2O95450 1211 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 NLRP13Q86W25 1043 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 SSH2Q76I76 1423 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 NGLY1Q96IV0 654 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 C8orf37Q96NL8 207 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PP64 1363 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 MYOM1P52179 1685 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 PLEKHG5O94827 1062 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 NLRP6P59044 892 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-224ENST00000551155 PIK3C2AO00443 1686 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 AFF2P51816 1311 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 USP19O94966 1318 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 GCP02774 474 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 USP21Q9UK80 565 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 USP54Q70EL1 1684 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 USP31Q70CQ4 1352 aa12.91□□□□□ -0.34
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CS-224ENST00000551155 SLIT3O75094 1523 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 FAM83GA6ND36 823 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-224ENST00000551155 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.9□□□□□ -0.34
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CS-224ENST00000551155 NME9Q86XW9 330 aa12.89□□□□□ -0.35
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CS-224ENST00000551155 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 CPDO75976 1380 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 KIAA0232Q92628 1395 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 SLIT2O94813 1529 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 UNC5CLQ8IV45 518 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 POTEAQ6S8J7 498 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 PANK3Q9H999 370 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 CCDC7Q96M83 1385 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 FYB1O15117 783 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 RXRBP28702 533 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 BTG4Q9NY30 223 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.86□□□□□ -0.35
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CS-224ENST00000551155 LTN1O94822 1766 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 CHRNA2Q15822 529 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 NRAPQ86VF7 1730 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 NFAT5O94916 1531 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 SOX12O15370 315 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 EVA1CP58658 441 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-224ENST00000551155 ATRNO75882 1429 aa12.84□□□□□ -0.35
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