RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 HRCP23327 699 aa9.95□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 LCE2CQ5TA81 110 aa9.95□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 LYPD8Q6UX82 237 aa9.95□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.95□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.95□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRDN-205ENST00000546248 CTHP32929 405 aa9.93□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.93□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.93□□□□□ -0.82
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRDN-205ENST00000546248 MAP10Q9P2G4 905 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRDN-205ENST00000546248 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.84□□□□□ -0.83
TRDN-205ENST00000546248 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRDN-205ENST00000546248 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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TRDN-205ENST00000546248 TIMP2P16035 220 aa9.83□□□□□ -0.84
TRDN-205ENST00000546248 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRDN-205ENST00000546248 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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TRDN-205ENST00000546248 ZFP42Q96MM3 310 aa9.82□□□□□ -0.84
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TRDN-205ENST00000546248 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.74□□□□□ -0.85
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TRDN-205ENST00000546248 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.73□□□□□ -0.85
TRDN-205ENST00000546248 H3BM21 787 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRDN-205ENST00000546248 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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TRDN-205ENST00000546248 ERFEQ4G0M1 354 aa9.67□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 MEIOBQ8N635 442 aa9.67□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.66□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 FAM117AQ9C073 453 aa9.66□□□□□ -0.86
TRDN-205ENST00000546248 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.66□□□□□ -0.86
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