RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-207ENST00000527677 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 NSD2O96028 1365 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 JCADQ9P266 1359 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 ABTB2Q8N961 1025 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 ALS2Q96Q42 1657 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 USP31Q70CQ4 1352 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 HSPA1LP34931 641 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 NLRP13Q86W25 1043 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-207ENST00000527677 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 USP54Q70EL1 1684 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 PIK3C2AO00443 1686 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 SHPRHQ149N8 1683 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 FYB1O15117 783 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 NLRP6P59044 892 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 COG3Q96JB2 828 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 NME9Q86XW9 330 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 USP19O94966 1318 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-207ENST00000527677 SLIT3O75094 1523 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-207ENST00000527677 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-207ENST00000527677 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-207ENST00000527677 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-207ENST00000527677 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.76■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 GCP02774 474 aa22.75■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 MORC1Q86VD1 984 aa22.75■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 CPDO75976 1380 aa22.73■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 RALBP1Q15311 655 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 ABCA3Q99758 1704 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 NFAT5O94916 1531 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-207ENST00000527677 ABCC6O95255 1503 aa22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 RTL1A6NKG5 1358 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 ANP32CO43423 234 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 KIAA0232Q92628 1395 aa22.64■■□□□ 1.22
TSTA3-207ENST00000527677 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 SOX12O15370 315 aa22.62■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 PLEKHG5O94827 1062 aa22.62■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 FLT4P35916 1363 aa22.61■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 LRP6O75581 1613 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 ADAMTS2O95450 1211 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 AMPHP49418 695 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 POLKQ9UBT6 870 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 IP6K1Q92551 441 aa22.58■■□□□ 1.21
TSTA3-207ENST00000527677 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 PPP2R1AP30153 589 aa22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 LTN1O94822 1766 aa22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 FAM83GA6ND36 823 aa22.56■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 CFAP53Q96M91 514 aa22.56■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 INSRP06213 1382 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 HOXC9P31274 260 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-207ENST00000527677 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms