RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 CFAP99D6REC4 459 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 MTMR2Q13614 643 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 QPCTQ16769 361 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 TSC1Q92574 1164 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 GMPRP36959 345 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 VEGFBP49765 207 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 LINC01559Q495D7 138 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 FAM117AQ9C073 453 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 BAP1Q92560 729 aa5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 CTHP32929 405 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 SCARF1Q14162 830 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-211ENST00000504624 SH3BP2P78314 561 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 KCNH2Q12809 1159 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 DIXDC1Q155Q3 683 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ZBTB3Q9H5J0 574 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 H3BM21 787 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 LILRB3O75022 631 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 NNTQ13423 1086 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 PTPRNQ16849 979 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 LCE2CQ5TA81 110 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 LYPD8Q6UX82 237 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ZFP42Q96MM3 310 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 MAP10Q9P2G4 905 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 SIAH2O43255 324 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 GJA5P36382 358 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 AGERQ15109 404 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF511Q8NB15 262 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 IL27Q8NEV9 243 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 FOXJ1Q92949 421 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 UPP2O95045 317 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ADH1CP00326 375 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ARID5BQ14865 1188 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 NEUROD2Q15784 382 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 DESI1Q6ICB0 168 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 ERBB4Q15303 1308 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 MAN1A2O60476 641 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-211ENST00000504624 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 SOBPA7XYQ1 873 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 AP1G2O75843 785 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 BMP2P12643 396 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 TIMP2P16035 220 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 MPNDQ8N594 471 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 NR6A1Q15406 480 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 NR5A1Q13285 461 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-211ENST00000504624 VSIG8P0DPA2 414 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 ITPKCQ96DU7 683 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 GRM5P41594 1212 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
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