RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ACEP12821 1306 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHG5O94827 1062 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf37Q96NL8 207 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PXDNQ92626 1479 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS2O95450 1211 aa18.55■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.55■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS12O14924 1447 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 NGLY1Q96IV0 654 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF39Q9H2S5 420 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 SBNO1A3KN83 1393 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 USP6P35125 1406 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PP64 1363 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 ABTB2Q8N961 1025 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF10O15013 1369 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC7Q96M83 1385 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP12Q02952 1782 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 USP21Q9UK80 565 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 MYOM1P52179 1685 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.46■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRP6P59044 892 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 PANK3Q9H999 370 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRP13Q86W25 1043 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 ALS2Q96Q42 1657 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 SOX12O15370 315 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NME9Q86XW9 330 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ATRNO75882 1429 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SSH2Q76I76 1423 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 PIK3C2AO00443 1686 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 COG3Q96JB2 828 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 EP400Q96L91 3159 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA3Q99758 1704 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 USP19O94966 1318 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GCP02774 474 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 FYB1O15117 783 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 USP31Q70CQ4 1352 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0232Q92628 1395 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CHRNA2Q15822 529 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.28■□□□□ 0.52
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