RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-216	ENST00000493752	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ABCD4-216	ENST00000493752	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ABCD4-216	ENST00000493752	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NLRP13	Q86W25	1043 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NLRP6	P59044	892 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	FYB1	O15117	783 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NME9	Q86XW9	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-216	ENST00000493752	GC	P02774	474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	COG3	Q96JB2	828 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	USP19	O94966	1318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	NSD2	O96028	1365 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	MYOM1	P52179	1685 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCD4-216	ENST00000493752	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	CPD	O75976	1380 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	SOX12	O15370	315 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	FBLN1	P23142	703 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	SLIT3	O75094	1523 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	LRP6	O75581	1613 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	IP6K1	Q92551	441 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	POLK	Q9UBT6	870 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	AMPH	P49418	695 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	RALBP1	Q15311	655 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ABCD4-216	ENST00000493752	EVA1C	P58658	441 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	USP21	Q9UK80	565 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	AFF2	P51816	1311 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	NFAT5	O94916	1531 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	HOXC9	P31274	260 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	SLIT2	O94813	1529 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	PPP2R1A	P30153	589 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	MTHFS	P49914	203 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-216	ENST00000493752	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms