RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474181.1

UBE2Q1-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLFN5Q08AF3 891 aa16.84■□□□□ 0.29
UBE2Q1-203ENST00000474181 PIK3R4Q99570 1358 aa16.84■□□□□ 0.29
UBE2Q1-203ENST00000474181 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
UBE2Q1-203ENST00000474181 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 COG3Q96JB2 828 aa16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.83■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.82■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.82■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.81■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.81■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NME9Q86XW9 330 aa16.8■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.79■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NEUROD2Q15784 382 aa16.79■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 WWC1Q8IX03 1113 aa16.79■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NUTM2FA1L443 756 aa16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NEFMP07197 916 aa16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 ACEP12821 1306 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCDC27Q2M243 656 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 WDR63Q8IWG1 891 aa16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1-203ENST00000474181 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 POLKQ9UBT6 870 aa16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.75■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 USP6P35125 1406 aa16.75■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.75■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 KCNA6P17658 529 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.72■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLIN1O60240 522 aa16.72■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 FCHSD2O94868 740 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2Q1-203ENST00000474181 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRBNQ96SW2 442 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 FBLN1P23142 703 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRKAR2BP31323 418 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 RIPK4P57078 832 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 IL16Q14005 1332 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 SSH2Q76I76 1423 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 IL13P35225 146 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2Q1-203ENST00000474181 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 HMOX1P09601 288 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 C14orf37Q86TY3 774 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 USP31Q70CQ4 1352 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 NFE2L2Q16236 605 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 NWD1Q149M9 1564 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 BCAR3O75815 825 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 SOX12O15370 315 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 PIK3C2AO00443 1686 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2Q1-203ENST00000474181 NLRP6P59044 892 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 PDE3AQ14432 1141 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 SBNO1A3KN83 1393 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 PEAK1Q9H792 1746 aa16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 USP54Q70EL1 1684 aa16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 FLT4P35916 1363 aa16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1-203ENST00000474181 AMPHP49418 695 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms