RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.71■■□□□ 1.07
SYP-204ENST00000469389 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.71■■□□□ 1.07
SYP-204ENST00000469389 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.7■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 ABTB2Q8N961 1025 aa21.7■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 PANK3Q9H999 370 aa21.7■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 JCADQ9P266 1359 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.68■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.68■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.66■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.66■■□□□ 1.06
SYP-204ENST00000469389 NLRP13Q86W25 1043 aa21.66■■□□□ 1.06
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SYP-204ENST00000469389 PLEKHG5O94827 1062 aa21.63■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.62■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.62■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 SHPRHQ149N8 1683 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 ALS2Q96Q42 1657 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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SYP-204ENST00000469389 SSH2Q76I76 1423 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.6■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NME9Q86XW9 330 aa21.59■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.58■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYP-204ENST00000469389 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.57■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 NSD2O96028 1365 aa21.57■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 PIK3C2AO00443 1686 aa21.56■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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SYP-204ENST00000469389 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.55■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 USP31Q70CQ4 1352 aa21.54■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.53■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 SOX12O15370 315 aa21.52■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 MORC1Q86VD1 984 aa21.52■■□□□ 1.04
SYP-204ENST00000469389 GCP02774 474 aa21.51■■□□□ 1.03
SYP-204ENST00000469389 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYP-204ENST00000469389 USP19O94966 1318 aa21.51■■□□□ 1.03
SYP-204ENST00000469389 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.49■■□□□ 1.03
SYP-204ENST00000469389 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SYP-204ENST00000469389 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYP-204ENST00000469389 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYP-204ENST00000469389 ABCA3Q99758 1704 aa21.46■■□□□ 1.03
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SYP-204ENST00000469389 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 NGLY1Q96IV0 654 aa21.44■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 C8orf37Q96NL8 207 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 CPDO75976 1380 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 KIAA0232Q92628 1395 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-204ENST00000469389 AMPHP49418 695 aa21.41■■□□□ 1.02
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SYP-204ENST00000469389 NFAT5O94916 1531 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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SYP-204ENST00000469389 ANP32CO43423 234 aa21.37■■□□□ 1.01
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SYP-204ENST00000469389 CHRNA2Q15822 529 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 LTN1O94822 1766 aa21.37■■□□□ 1.01
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SYP-204ENST00000469389 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 BTG4Q9NY30 223 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYP-204ENST00000469389 ABCC6O95255 1503 aa21.33■■□□□ 1
SYP-204ENST00000469389 AFF2P51816 1311 aa21.32■■□□□ 1
SYP-204ENST00000469389 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYP-204ENST00000469389 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.32■■□□□ 1
SYP-204ENST00000469389 IP6K1Q92551 441 aa21.32■■□□□ 1
SYP-204ENST00000469389 CFAP53Q96M91 514 aa21.32■■□□□ 1
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