RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.89■■□□□ 1.9
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SNHG12-201ENST00000461448 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.87■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 SSH2Q76I76 1423 aa26.86■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.86■■□□□ 1.89
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SNHG12-201ENST00000461448 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.85■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 ABTB2Q8N961 1025 aa26.85■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.84■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SNHG12-201ENST00000461448 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.83■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 PLEKHG5O94827 1062 aa26.82■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.82■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 NME9Q86XW9 330 aa26.81■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.8■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF10O15013 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
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SNHG12-201ENST00000461448 JCADQ9P266 1359 aa26.78■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.77■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.77■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.77■■□□□ 1.88
SNHG12-201ENST00000461448 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 NLRP13Q86W25 1043 aa26.76■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 ALS2Q96Q42 1657 aa26.76■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 FYB1O15117 783 aa26.76■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.75■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.73■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 PIK3C2AO00443 1686 aa26.73■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 COG3Q96JB2 828 aa26.72■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SNHG12-201ENST00000461448 USP31Q70CQ4 1352 aa26.7■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 SHPRHQ149N8 1683 aa26.68■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 SOX12O15370 315 aa26.67■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 USP19O94966 1318 aa26.67■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 NSD2O96028 1365 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SNHG12-201ENST00000461448 GCP02774 474 aa26.64■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.64■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 MORC1Q86VD1 984 aa26.63■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.62■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 ADAMTS2O95450 1211 aa26.61■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 SLIT3O75094 1523 aa26.6■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 USP54Q70EL1 1684 aa26.59■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.58■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SNHG12-201ENST00000461448 FBLN1P23142 703 aa26.57■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.57■■□□□ 1.84
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SNHG12-201ENST00000461448 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 ANP32CO43423 234 aa26.55■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 LRP6O75581 1613 aa26.55■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.54■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.54■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA0232Q92628 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 NFAT5O94916 1531 aa26.52■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 RALBP1Q15311 655 aa26.52■■□□□ 1.84
SNHG12-201ENST00000461448 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.51■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 CPDO75976 1380 aa26.5■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 FAM83GA6ND36 823 aa26.5■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 C8orf37Q96NL8 207 aa26.5■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.48■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.48■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 NGLY1Q96IV0 654 aa26.47■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 AMPHP49418 695 aa26.47■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.47■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.46■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 POLKQ9UBT6 870 aa26.46■■□□□ 1.83
SNHG12-201ENST00000461448 PPP2R1AP30153 589 aa26.41■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 IP6K1Q92551 441 aa26.41■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 BTG4Q9NY30 223 aa26.41■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 HOXC9P31274 260 aa26.4■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 MTHFSP49914 203 aa26.4■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.4■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 LTN1O94822 1766 aa26.4■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SNHG12-201ENST00000461448 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
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