RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SMAPO00193 183 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC10A3P09131 477 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L24Q0WX57 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.18□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 C8orf37Q96NL8 207 aa7.18□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 VAMP1P23763 118 aa7.17□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO45P0C2W1 286 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP2B4P23634 1241 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 PTK7Q13308 1070 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 RASA1P20936 1047 aa7.15□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A3P48751 1232 aa7.14□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.14□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 LHX6Q9UPM6 363 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V1AP38606 617 aa7.13□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 PROX2Q3B8N5 592 aa7.12□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 BCL11AQ9H165 835 aa7.11□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.11□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.1□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.1□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 MMRN1Q13201 1228 aa7.09□□□□□ -1.27
CBX1P4-201ENST00000439415 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.09□□□□□ -1.27
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CBX1P4-201ENST00000439415 EML3Q32P44 896 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 Q3C1V9 767 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM50Q86XT4 487 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF135Q8IUD6 432 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 OGFOD1Q8N543 542 aa7.08□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ABL1P00519 1130 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 SCNN1AP37088 669 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP1A2P50993 1020 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 UBXN4Q92575 508 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MARVELD3Q96A59 401 aa7.07□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BRB1 525 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ICMTO60725 284 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 RECKO95980 971 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK1P28482 360 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 COL19A1Q14993 1142 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNH8Q96L42 1107 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB16Q96NS5 453 aa7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNH2Q12809 1159 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MORN1Q5T089 497 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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