RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TRAK2O60296 914 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CLCN1P35523 988 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PRAM1Q96QH2 718 aa18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PANK2Q9BZ23 570 aa18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MLECQ14165 292 aa18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MRE11P49959 708 aa18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRB2O60241 1585 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 RICTORQ6R327 1708 aa18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3C2BO00750 1634 aa18.81■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 HSCBQ8IWL3 235 aa18.81■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PP64 1363 aa18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.78■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.77■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 SMC5Q8IY18 1101 aa18.77■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDIT3P35638 169 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM27P14373 513 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE9O95405 1425 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 NSD2O96028 1365 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SNX21Q969T3 373 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CDK19Q9BWU1 502 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CABP1Q9NZU7 370 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 FYB1O15117 783 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TSPOAP1O95153 1857 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC11Q96J66 1382 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRMP28827 1452 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ESPNB1AK53 854 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 FBLN1P23142 703 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 GBP4Q96PP9 640 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 NUCB1Q02818 461 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IL16Q14005 1332 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PTMSP20962 102 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 KIF16BQ96L93 1317 aa18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ERBB4Q15303 1308 aa18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ALKQ9UM73 1620 aa18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 LNPKQ9C0E8 428 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 DIP2BQ9P265 1576 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms