RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TRAK2O60296 914 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CLCN1P35523 988 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.86■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PRAM1Q96QH2 718 aa18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PANK2Q9BZ23 570 aa18.85■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MLECQ14165 292 aa18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.84■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MRE11P49959 708 aa18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.83■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRB2O60241 1585 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 RICTORQ6R327 1708 aa18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.82■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3C2BO00750 1634 aa18.81■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 HSCBQ8IWL3 235 aa18.81■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PP64 1363 aa18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.78■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.77■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 SMC5Q8IY18 1101 aa18.77■□□□□ 0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DDIT3P35638 169 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM27P14373 513 aa18.76■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE9O95405 1425 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 NSD2O96028 1365 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SNX21Q969T3 373 aa18.75■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CDK19Q9BWU1 502 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.74■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CABP1Q9NZU7 370 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 FYB1O15117 783 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TSPOAP1O95153 1857 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC11Q96J66 1382 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRMP28827 1452 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ESPNB1AK53 854 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 FBLN1P23142 703 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 GBP4Q96PP9 640 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 NUCB1Q02818 461 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IL16Q14005 1332 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PTMSP20962 102 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.67■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 KIF16BQ96L93 1317 aa18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ERBB4Q15303 1308 aa18.66■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ALKQ9UM73 1620 aa18.65■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
TOP3B-206ENST00000436282 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 LNPKQ9C0E8 428 aa18.64■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 DIP2BQ9P265 1576 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.62■□□□□ 0.57
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