RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDE4AP27815 886 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLKQ9UBT6 870 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGS3P49796 1198 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR63Q8IWG1 891 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RLBP1P12271 317 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RIPK4P57078 832 aa16.4■□□□□ 0.22
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DLC1Q96QB1 1528 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOX12O15370 315 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRKAR2BP31323 418 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC27Q2M243 656 aa16.38■□□□□ 0.21
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BACH2Q9BYV9 841 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.37■□□□□ 0.21
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP7BP35670 1465 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MED14O60244 1454 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPS1P31327 1500 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COG3Q96JB2 828 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDE3AQ14432 1141 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADGRB2O60241 1585 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MS4A1P11836 297 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EID1Q9Y6B2 187 aa16.32■□□□□ 0.2
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACEP12821 1306 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPRUQ92729 1446 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCHSD2O94868 740 aa16.3■□□□□ 0.2
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TECPR2O15040 1411 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL13P35225 146 aa16.29■□□□□ 0.2
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEFMP07197 916 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM83GA6ND36 823 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DCTN1Q14203 1278 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NBR1Q14596 966 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIRT1Q96EB6 747 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C3P01024 1663 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.26■□□□□ 0.19
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NFE2L2Q16236 605 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C8orf34Q49A92 452 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSPYL6Q8N831 410 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNA6P17658 529 aa16.22■□□□□ 0.19
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