RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.58■■□□□ 1.05
GAREM2-202ENST00000407684 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 PTMSP20962 102 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 GSE1Q14687 1217 aa21.56■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 NME9Q86XW9 330 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 PDE4AP27815 886 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 CRBNQ96SW2 442 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 PLA2R1Q13018 1463 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 GPATCH3Q96I76 525 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 FCHSD2O94868 740 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 MYOM2P54296 1465 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 ERVK-7P63135 1459 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-202ENST00000407684 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 ACEP12821 1306 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 FAM161AQ3B820 660 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 WDR63Q8IWG1 891 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 DRC7Q8IY82 874 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 GLI2P10070 1586 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 GORABQ5T7V8 394 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 COG6Q9Y2V7 657 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 KIF1BO60333 1816 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 KIF16BQ96L93 1317 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 FOXO3O43524 673 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-202ENST00000407684 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.45■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 ABCC11Q96J66 1382 aa21.44■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.44■■□□□ 1.02
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GAREM2-202ENST00000407684 KCNA6P17658 529 aa21.44■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 ARID3AQ99856 593 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 SIRT1Q96EB6 747 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 CLSTN1O94985 981 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 NLRP1Q9C000 1473 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 MSH6P52701 1360 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 NFE2L2Q16236 605 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 LTKP29376 864 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 SLC4A3P48751 1232 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.4■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.39■■□□□ 1.02
GAREM2-202ENST00000407684 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.39■■□□□ 1.01
GAREM2-202ENST00000407684 PIK3C2GO75747 1445 aa21.39■■□□□ 1.01
GAREM2-202ENST00000407684 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.38■■□□□ 1.01
GAREM2-202ENST00000407684 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GAREM2-202ENST00000407684 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GAREM2-202ENST00000407684 WWC1Q8IX03 1113 aa21.38■■□□□ 1.01
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