RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 IL16Q14005 1332 aa29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 USP35Q9P2H5 1018 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP7BP35670 1465 aa29.64■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 TSPOAP1O95153 1857 aa29.62■■■□□ 2.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZMYM3Q14202 1370 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 RLBP1P12271 317 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.6■■■□□ 2.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 NEFMP07197 916 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 BCL11AQ9H165 835 aa29.51■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.51■■■□□ 2.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 SIRT1Q96EB6 747 aa29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 POLKQ9UBT6 870 aa29.47■■■□□ 2.31
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RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.46■■■□□ 2.31
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RABGGTA-202ENST00000399409 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
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RABGGTA-202ENST00000399409 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.45■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.43■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.42■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF428Q96B54 188 aa29.41■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.4■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC4A3P48751 1232 aa29.4■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
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RABGGTA-202ENST00000399409 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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RABGGTA-202ENST00000399409 GNAI1P63096 354 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 ITSN1Q15811 1721 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.28■■■□□ 2.28
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