RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK19Q9BWU1 502 aa19.82■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.82■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.82■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.81■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 ESPNB1AK53 854 aa19.81■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 GNAI2P04899 355 aa19.81■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCC11Q96J66 1382 aa19.81■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTROBQ8N137 903 aa19.8■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.8■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.8■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.79■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPY26PQ9H489 355 aa19.79■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC4A2P04920 1241 aa19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 NFE2L2Q16236 605 aa19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.77■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.77■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TPM3P06753 285 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF592Q92610 1267 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMA5P28066 241 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TOMM22Q9NS69 142 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHDP01880 384 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 PDCP20941 246 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRP6P59044 892 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.73■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.73■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 CPLX1O14810 134 aa19.73■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.73■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 IFT57Q9NWB7 429 aa19.72■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.72■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.72■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.71■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM27P14373 513 aa19.71■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.71■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP160Q12769 1436 aa19.71■□□□□ 0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa19.7■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FIBPO43427 364 aa19.7■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC27Q2M243 656 aa19.7■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 PSME1Q06323 249 aa19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 RASSF8Q8NHQ8 419 aa19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 HIP1O00291 1037 aa19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 NSD2O96028 1365 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf34Q49A92 452 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FSD1Q9BTV5 496 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM29Q14134 588 aa19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TRDNQ13061 729 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 HOMER1Q86YM7 354 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TESK2Q96S53 571 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 CREBRFQ8IUR6 639 aa19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM5Q9C035 493 aa19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 RRP9O43818 475 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TPM1P09493 284 aa19.64■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 IL16Q14005 1332 aa19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms