RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	34.17	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		34.17	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	34.16	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SBNO1	A3KN83	1393 aa		34.16	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	34.15	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SSH2	Q76I76	1423 aa		34.12	■■■■□ 3.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PANK3	Q9H999	370 aa		34.11	■■■■□ 3.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		34.11	■■■■□ 3.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		34.08	■■■■□ 3.05
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
GKAP1-204	ENST00000388782	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		34.07	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		34.06	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		34.06	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	ALS2	Q96Q42	1657 aa		34.06	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	ARHGEF10	O15013	1369 aa		34.05	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		34.03	■■■■□ 3.04
GKAP1-204	ENST00000388782	PIK3C2A	O00443	1686 aa		34	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	34	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
GKAP1-204	ENST00000388782	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.94	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	NME9	Q86XW9	330 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	NSD2	O96028	1365 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	NLRP6	P59044	892 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GKAP1-204	ENST00000388782	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	FYB1	O15117	783 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	USP19	O94966	1318 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	COG3	Q96JB2	828 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.84	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SLIT3	O75094	1523 aa		33.84	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.84	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.84	■■■■□ 3.01
GKAP1-204	ENST00000388782	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
GKAP1-204	ENST00000388782	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.81	■■■■□ 3
GKAP1-204	ENST00000388782	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.77	■■■■□ 3
GKAP1-204	ENST00000388782	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	GC	P02774	474 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	NFAT5	O94916	1531 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GKAP1-204	ENST00000388782	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	SOX12	O15370	315 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	CPD	O75976	1380 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	LRP6	O75581	1613 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GKAP1-204	ENST00000388782	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.62	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	LTN1	O94822	1766 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	ABCC6	O95255	1503 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	RALBP1	Q15311	655 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GKAP1-204	ENST00000388782	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.56	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.56	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	FBLN1	P23142	703 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GKAP1-204	ENST00000388782	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
GKAP1-204	ENST00000388782	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GKAP1-204	ENST00000388782	COL18A1	P39060	1754 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GKAP1-204	ENST00000388782	ANP32C	O43423	234 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GKAP1-204	ENST00000388782	AMPH	P49418	695 aa		33.5	■■■□□ 2.95

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