RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 PRAM1Q96QH2 718 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 ARHGEF11O15085 1522 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 ERC2O15083 957 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 MCM2P49736 904 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 CABP1Q9NZU7 370 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 IQGAP2Q13576 1575 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 FBXW7Q969H0 707 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 TRIM27P14373 513 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SSFA2P28290 1259 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 PANK2Q9BZ23 570 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SLC4A2P04920 1241 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 FOSBP53539 338 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 UQCRHP07919 91 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 GNAI3P08754 354 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 RNF20Q5VTR2 975 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-202ENST00000353284 SYCE3A1L190 88 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 SPC24Q8NBT2 197 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CUL7Q14999 1698 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 SEC24BO95487 1268 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 HOMEZQ8IX15 550 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 TRIM5Q9C035 493 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 TOMM22Q9NS69 142 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 GNAI2P04899 355 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 HOMER1Q86YM7 354 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 FCHSD2O94868 740 aa14.49□□□□□ -0.09
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PTPRS-202ENST00000353284 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF428Q96B54 188 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CDK19Q9BWU1 502 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 TNNQ9UQP3 1299 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CNTROBQ8N137 903 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 NFE2L2Q16236 605 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 NPHP1O15259 732 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 TESK2Q96S53 571 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-202ENST00000353284 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
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PTPRS-202ENST00000353284 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 CPLX1O14810 134 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 RLBP1P12271 317 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 CLCN1P35523 988 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 DCTN1Q14203 1278 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 SDF4Q9BRK5 362 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 TPM3P06753 285 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PTPRS-202ENST00000353284 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.44□□□□□ -0.1
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