RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.88■■□□□ 1.89
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KCNQ1-202ENST00000335475 PANK1Q8TE04 598 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.87■■□□□ 1.89
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KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.86■■□□□ 1.89
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KCNQ1-202ENST00000335475 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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KCNQ1-202ENST00000335475 COG6Q9Y2V7 657 aa26.84■■□□□ 1.89
KCNQ1-202ENST00000335475 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.83■■□□□ 1.89
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KCNQ1-202ENST00000335475 ITSN1Q15811 1721 aa26.8■■□□□ 1.88
KCNQ1-202ENST00000335475 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
KCNQ1-202ENST00000335475 C3P01024 1663 aa26.8■■□□□ 1.88
KCNQ1-202ENST00000335475 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.8■■□□□ 1.88
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KCNQ1-202ENST00000335475 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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KCNQ1-202ENST00000335475 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.78■■□□□ 1.88
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KCNQ1-202ENST00000335475 FAM161AQ3B820 660 aa26.75■■□□□ 1.87
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KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.68■■□□□ 1.86
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KCNQ1-202ENST00000335475 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.67■■□□□ 1.86
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KCNQ1-202ENST00000335475 IL13P35225 146 aa26.64■■□□□ 1.86
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KCNQ1-202ENST00000335475 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.63■■□□□ 1.85
KCNQ1-202ENST00000335475 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.63■■□□□ 1.85
KCNQ1-202ENST00000335475 LTKP29376 864 aa26.63■■□□□ 1.85
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLIT1O75093 1534 aa26.61■■□□□ 1.85
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KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.61■■□□□ 1.85
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KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM27P14373 513 aa26.6■■□□□ 1.85
KCNQ1-202ENST00000335475 NFE2L2Q16236 605 aa26.6■■□□□ 1.85
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KCNQ1-202ENST00000335475 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.59■■□□□ 1.85
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KCNQ1-202ENST00000335475 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.57■■□□□ 1.84
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KCNQ1-202ENST00000335475 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.57■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.57■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.56■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 NEFMP07197 916 aa26.54■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.53■■□□□ 1.84
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KCNQ1-202ENST00000335475 KIF16BQ96L93 1317 aa26.53■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 USP6P35125 1406 aa26.52■■□□□ 1.84
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