RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF3CO14782 793 aa13.9□□□□□ -0.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZFYVE9O95405 1425 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.89□□□□□ -0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.87□□□□□ -0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.86□□□□□ -0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.83□□□□□ -0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
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RABGGTB-201ENST00000319942 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.8□□□□□ -0.2
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RABGGTB-201ENST00000319942 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 BCANQ96GW7 911 aa13.8□□□□□ -0.2
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RABGGTB-201ENST00000319942 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.79□□□□□ -0.2
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RABGGTB-201ENST00000319942 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 PANK3Q9H999 370 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 RALBP1Q15311 655 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 STK26Q9P289 416 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 MROH2AA6NES4 1674 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP1Q9C000 1473 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 POGKQ9P215 609 aa13.77□□□□□ -0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 MFRPQ9BY79 579 aa13.76□□□□□ -0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 EVC2Q86UK5 1308 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 TMC2Q8TDI7 906 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT172Q9UG01 1749 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRB1O14514 1584 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 MRS2Q9HD23 443 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 STK24Q9Y6E0 443 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 HRO43593 1189 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 IQGAP1P46940 1657 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT1Q96EB6 747 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAM1Q96QH2 718 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC11Q96J66 1382 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TMC1Q8TDI8 760 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LTKP29376 864 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKQ9UM73 1620 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX22Q9Y458 520 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS20O76081 388 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP13Q86W25 1043 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 METP08581 1390 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC184Q52MB2 194 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
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