RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.89■■□□□ 1.9
PTDSS2-201ENST00000308020 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.89■■□□□ 1.9
PTDSS2-201ENST00000308020 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.89■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 GSE1Q14687 1217 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 AGLP35573 1532 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 AAMPQ13685 434 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 IL27Q8NEV9 243 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.84■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.83■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 REREQ9P2R6 1566 aa26.83■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
PTDSS2-201ENST00000308020 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.82■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.82■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 NLRP1Q9C000 1473 aa26.81■■□□□ 1.88
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PTDSS2-201ENST00000308020 FBLN1P23142 703 aa26.79■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.79■■□□□ 1.88
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PTDSS2-201ENST00000308020 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ADGRB2O60241 1585 aa26.78■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.78■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MED14O60244 1454 aa26.76■■□□□ 1.88
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PTDSS2-201ENST00000308020 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.75■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.75■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.74■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ZMYM3Q14202 1370 aa26.73■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.73■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RIPK4P57078 832 aa26.72■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BECN1Q14457 450 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 METP08581 1390 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DLC1Q96QB1 1528 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM27P14373 513 aa26.7■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 POLKQ9UBT6 870 aa26.69■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.68■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.68■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.67■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.66■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.66■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP7BP35670 1465 aa26.66■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.64■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.64■■□□□ 1.86
PTDSS2-201ENST00000308020 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.64■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 FCHSD2O94868 740 aa26.64■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 NME9Q86XW9 330 aa26.64■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 PRKAR2BP31323 418 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.62■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.62■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 IL16Q14005 1332 aa26.62■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 HMOX1P09601 288 aa26.61■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.61■■□□□ 1.85
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PTDSS2-201ENST00000308020 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.59■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.59■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS2-201ENST00000308020 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TNRQ92752 1358 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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PTDSS2-201ENST00000308020 KIF16BQ96L93 1317 aa26.53■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 COG3Q96JB2 828 aa26.53■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.53■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.52■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SMC5Q8IY18 1101 aa26.52■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTDSS2-201ENST00000308020 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
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PTDSS2-201ENST00000308020 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.51■■□□□ 1.83
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