RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.01■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 ITSN1Q15811 1721 aa30.01■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.01■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R2Q9NY27 417 aa30■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 ACEP12821 1306 aa30■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.99■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 SLFN5Q08AF3 891 aa29.98■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 NGEFQ8N5V2 710 aa29.98■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 POLKQ9UBT6 870 aa29.97■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.97■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.97■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.97■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
VSTM4-201ENST00000298454 NEUROD2Q15784 382 aa29.95■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.94■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 WWC1Q8IX03 1113 aa29.94■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 COG3Q96JB2 828 aa29.94■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.92■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.91■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 USP6P35125 1406 aa29.91■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.91■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.9■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.88■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.88■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 E9PSI1 815 aa29.88■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.87■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 SSH2Q76I76 1423 aa29.83■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 PLIN1O60240 522 aa29.83■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
VSTM4-201ENST00000298454 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.82■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC27Q2M243 656 aa29.82■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.8■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.8■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.8■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.79■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.78■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 WDR63Q8IWG1 891 aa29.77■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.77■■■□□ 2.36
VSTM4-201ENST00000298454 IL13P35225 146 aa29.76■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.76■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 FCHSD2O94868 740 aa29.74■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.74■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.73■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 HMOX1P09601 288 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 USP31Q70CQ4 1352 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAR2BP31323 418 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.7■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.7■■■□□ 2.35
VSTM4-201ENST00000298454 SOX12O15370 315 aa29.69■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.69■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.68■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 RIPK4P57078 832 aa29.67■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 BCAR3O75815 825 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3C2AO00443 1686 aa29.65■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 C14orf37Q86TY3 774 aa29.65■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 CRBNQ96SW2 442 aa29.65■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.65■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 NWD1Q149M9 1564 aa29.65■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.64■■■□□ 2.34
VSTM4-201ENST00000298454 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.63■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 NEFMP07197 916 aa29.62■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 PEAK1Q9H792 1746 aa29.62■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP6P59044 892 aa29.61■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.61■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.6■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.6■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.6■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
VSTM4-201ENST00000298454 ABTB2Q8N961 1025 aa29.57■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 NFE2L2Q16236 605 aa29.56■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.56■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA2P54652 639 aa29.56■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 IL16Q14005 1332 aa29.54■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
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