RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.82■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 RIPK4P57078 832 aa27.79■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 EID1Q9Y6B2 187 aa27.79■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.78■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 STK26Q9P289 416 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 SLIT1O75093 1534 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.032e-6■■■■□ 20
PITX1-201ENST00000265340 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 USP19O94966 1318 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 ALKQ9UM73 1620 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 OFD1O75665 1012 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 MCM4P33991 863 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 HSPA2P54652 639 aa27.7■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.7■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.7■■■□□ 2.03
PITX1-201ENST00000265340 DMTNQ08495 405 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 PLIN1O60240 522 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 EVC2Q86UK5 1308 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 CABP2Q9NPB3 220 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 INSRP06213 1382 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 METP08581 1390 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 TRAK2O60296 914 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.64■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.64■■■□□ 2.02
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.64■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 PRAM1Q96QH2 718 aa27.63■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.6■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.58■■■□□ 2.01
PITX1-201ENST00000265340 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.57■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.55■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.53■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 MED14O60244 1454 aa27.53■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 MORC1Q86VD1 984 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 USP32Q8NFA0 1604 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 TBX22Q9Y458 520 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-201ENST00000265340 KIF20AO95235 890 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CCDC173Q0VFZ6 552 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 PTPRUQ92729 1446 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 DYNC1I1O14576 645 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PP64 1363 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 TMEM51Q9NW97 253 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 ABCC11Q96J66 1382 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CDK19Q9BWU1 502 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 DLC1Q96QB1 1528 aa27.45■■□□□ 1.99
PITX1-201ENST00000265340 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 UQCRHLA0A096LP55 91 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 UQCRHP07919 91 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 SEC24BO95487 1268 aa27.42■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.5 ms