RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.89■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.89■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 MCM4P33991 863 aa18.88■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PP64 1363 aa18.87■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 ABCC11Q96J66 1382 aa18.87■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 SMC5Q8IY18 1101 aa18.87■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 ABCC3O15438 1527 aa18.87■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.87■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.86■□□□□ 0.61
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SYP-201ENST00000263233 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.85■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.85■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 PIK3C2BO00750 1634 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 IL16Q14005 1332 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 FSD2A1L4K1 749 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.84■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.83■□□□□ 0.61
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SYP-201ENST00000263233 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.83■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.82■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.82■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 RIPK4P57078 832 aa18.81■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
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SYP-201ENST00000263233 ARXQ96QS3 562 aa18.8■□□□□ 0.6
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SYP-201ENST00000263233 HSCBQ8IWL3 235 aa18.8■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 FYB1O15117 783 aa18.79■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 TRAK2O60296 914 aa18.79■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 NUCB1Q02818 461 aa18.79■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 KIF16BQ96L93 1317 aa18.79■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.79■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 MED14O60244 1454 aa18.78■□□□□ 0.6
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SYP-201ENST00000263233 STK26Q9P289 416 aa18.78■□□□□ 0.6
SYP-201ENST00000263233 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.77■□□□□ 0.6
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SYP-201ENST00000263233 ZFYVE9O95405 1425 aa18.74■□□□□ 0.59
SYP-201ENST00000263233 IDI1Q13907 227 aa18.74■□□□□ 0.59
SYP-201ENST00000263233 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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SYP-201ENST00000263233 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SYP-201ENST00000263233 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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SYP-201ENST00000263233 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.71■□□□□ 0.59
SYP-201ENST00000263233 NEO1Q92859 1461 aa18.71■□□□□ 0.59
SYP-201ENST00000263233 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.58
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SYP-201ENST00000263233 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.71■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 PRAM1Q96QH2 718 aa18.71■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.7■□□□□ 0.58
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SYP-201ENST00000263233 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.67■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 GCC1Q96CN9 775 aa18.66■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.66■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.66■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 VAMP4O75379 141 aa18.66■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
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