RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRE11P49959 708 aa26.68■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.68■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEO1Q92859 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 IDI1Q13907 227 aa26.67■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.67■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBLN1P23142 703 aa26.66■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 STAC3Q96MF2 364 aa26.65■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.65■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF1BO60333 1816 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ESPNB1AK53 854 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 STK26Q9P289 416 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC27Q2M243 656 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.63■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 AAMPQ13685 434 aa26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMC5Q8IY18 1101 aa26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCC3O15438 1527 aa26.62■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.61■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.61■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.6■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIPK4P57078 832 aa26.6■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSFA2P28290 1259 aa26.59■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDIT3P35638 169 aa26.58■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF2CQ99661 725 aa26.58■■□□□ 1.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RICTORQ6R327 1708 aa26.57■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.56■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.56■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.56■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUCB1Q02818 461 aa26.56■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZMYM3Q14202 1370 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC24A1O60721 1099 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYOM2P54296 1465 aa26.53■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.53■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.53■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.51■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.51■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRB3O60242 1522 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIP2BQ9P265 1576 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.5■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.49■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.49■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPYL6Q8N831 410 aa26.48■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GBP4Q96PP9 640 aa26.48■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 EVC2Q86UK5 1308 aa26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMOX1P09601 288 aa26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX21Q969T3 373 aa26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZMYND15Q9H091 742 aa26.46■■□□□ 1.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PP64 1363 aa26.45■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PKP1Q13835 747 aa26.45■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.44■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 APBB1O00213 710 aa26.44■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.44■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 AK9Q5TCS8 1911 aa26.43■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.43■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.42■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FYB1O15117 783 aa26.42■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT172Q9UG01 1749 aa26.41■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.41■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKAR2BP31323 418 aa26.4■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 MCTP1Q6DN14 999 aa26.4■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.4■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF16BQ96L93 1317 aa26.4■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.39■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.39■■□□□ 1.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRB1O14514 1584 aa26.38■■□□□ 1.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPLO60437 1756 aa26.38■■□□□ 1.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.38■■□□□ 1.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms