RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 TRIM27P14373 513 aa23.37■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 CDK19Q9BWU1 502 aa23.37■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 RICTORQ6R327 1708 aa23.37■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 ADGRB2O60241 1585 aa23.37■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 RIPK4P57078 832 aa23.36■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 NLRP1Q9C000 1473 aa23.36■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.35■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.35■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 GSE1Q14687 1217 aa23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 ZFYVE9O95405 1425 aa23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 TSPOAP1O95153 1857 aa23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.33■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.32■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.32■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.31■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.29■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.28■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.28■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 AAMPQ13685 434 aa23.27■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.27■■□□□ 1.32
PRDM12-201ENST00000253008 HMOX1P09601 288 aa23.26■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 ALKQ9UM73 1620 aa23.26■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 PRKAR2BP31323 418 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 POLKQ9UBT6 870 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 MLECQ14165 292 aa23.25■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 DIP2BQ9P265 1576 aa23.24■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.24■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.23■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.23■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.21■■□□□ 1.31
PRDM12-201ENST00000253008 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.2■■□□□ 1.3
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PRDM12-201ENST00000253008 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 MED14O60244 1454 aa23.19■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 IL16Q14005 1332 aa23.19■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 BECN1Q14457 450 aa23.19■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 NME9Q86XW9 330 aa23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 TSPYL6Q8N831 410 aa23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 FCHSD2O94868 740 aa23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.18■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.16■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.15■■□□□ 1.3
PRDM12-201ENST00000253008 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.14■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 SMC5Q8IY18 1101 aa23.14■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 LNPKQ9C0E8 428 aa23.14■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.13■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.12■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.12■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 KIF16BQ96L93 1317 aa23.12■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 ZMYM3Q14202 1370 aa23.11■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.11■■□□□ 1.29
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PRDM12-201ENST00000253008 NFE2L2Q16236 605 aa23.1■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 METP08581 1390 aa23.1■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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PRDM12-201ENST00000253008 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.1■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 IL13P35225 146 aa23.09■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 DCTN1Q14203 1278 aa23.09■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.08■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 MBIPQ9NS73 344 aa23.08■■□□□ 1.29
PRDM12-201ENST00000253008 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.07■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 NUCB1Q02818 461 aa23.07■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.05■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.04■■□□□ 1.28
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