RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 PRAM1Q96QH2 718 aa21.05■□□□□ 0.96
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HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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HOXD3-201ENST00000249440 SEC24BO95487 1268 aa20.93■□□□□ 0.94
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HOXD3-201ENST00000249440 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.84■□□□□ 0.93
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HOXD3-201ENST00000249440 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.83■□□□□ 0.93
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HOXD3-201ENST00000249440 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.82■□□□□ 0.92
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HOXD3-201ENST00000249440 ZNF428Q96B54 188 aa20.82■□□□□ 0.92
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HOXD3-201ENST00000249440 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.78■□□□□ 0.92
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HOXD3-201ENST00000249440 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 IL13P35225 146 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 GNAI1P63096 354 aa20.72■□□□□ 0.91
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