RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.19
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PRRX1-201ENST00000239461 CABP2Q9NPB3 220 aa13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 NEUROD2Q15784 382 aa13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 INSRP06213 1382 aa13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.81□□□□□ -0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.8□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 TBX22Q9Y458 520 aa13.8□□□□□ -0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.78□□□□□ -0.2
PRRX1-201ENST00000239461 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.78□□□□□ -0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.76□□□□□ -0.21
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PRRX1-201ENST00000239461 KIF1AQ12756 1690 aa13.74□□□□□ -0.21
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PRRX1-201ENST00000239461 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.74□□□□□ -0.21
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PRRX1-201ENST00000239461 MST1RQ04912 1400 aa13.7□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 COG3Q96JB2 828 aa13.7□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 MS4A1P11836 297 aa13.69□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.68□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL34Q8N239 644 aa13.68□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 PEAK1Q9H792 1746 aa13.67□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.65□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PRRX1-201ENST00000239461 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
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PRRX1-201ENST00000239461 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.64□□□□□ -0.23
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PRRX1-201ENST00000239461 PLIN1O60240 522 aa13.63□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.63□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.63□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.63□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 MSH5O43196 834 aa13.62□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PRRX1-201ENST00000239461 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.62□□□□□ -0.23
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