RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 PPTC7Q8NI37 304 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ACTR8Q9H981 624 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BTBD19C9JJ37 291 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PDE5AO76074 875 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ATP4AP20648 1035 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MATKP42679 507 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 JAM2P57087 298 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MYLPFQ96A32 169 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ACOX2Q99424 681 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCT7Q99832 543 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF670Q9BS34 389 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LRCH4O75427 683 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KATNA1O75449 491 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SOAT1P35610 550 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ARL2P36404 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EML3Q32P44 896 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MIER2Q8N344 545 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 A0A1W2PPM1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PIGNO95427 931 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CERS2Q96G23 380 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RBBP8Q99708 897 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DSG1Q02413 1049 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KYQ8NBH2 561 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDH9Q9ULB4 789 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PIRTP0C851 137 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FUKQ8N0W3 1084 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 GPR152Q8TDT2 470 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 IL22Q9GZX6 179 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 IPPQ9Y573 584 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TREHO43280 583 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ACADSP16219 412 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF23P17027 643 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MAXP61244 160 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF284Q2VY69 593 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCNB1P14635 433 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BST1Q10588 318 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PLD1Q13393 1074 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TTC27Q6P3X3 843 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MBOAT7Q96N66 472 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PROCP04070 461 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CD86P42081 329 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCL23P55773 120 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 GBE1Q04446 702 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DDR2Q16832 855 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TFAP2BQ92481 460 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ALOX15BO15296 676 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ALADP13716 330 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FLT3LGP49771 235 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms