RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RAB26	Q9ULW5	256 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SOX13	Q9UN79	622 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KRT1	P04264	644 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MYL2	P10916	166 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	GRK4	P32298	578 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA13	P48723	471 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SNX16	P57768	344 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CREB5	Q02930	508 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	OVGP1	Q12889	678 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KRT81	Q14533	505 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ACAP1	Q15027	740 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PMF1	Q6P1K2	205 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	OSTM1	Q86WC4	334 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TNIP3	Q96KP6	325 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	C7orf26	Q96N11	449 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CYTH2	Q99418	400 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	THTPA	Q9BU02	230 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		15.71	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0U1RQF3	1178 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PDE5A	O76074	875 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TFAP2A	P05549	437 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SCNN1G	P51170	649 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	NR1H2	P55055	460 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MTTP	P55157	894 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SFT2D3	Q587I9	215 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM110	Q86TL2	294 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PGBD4	Q96DM1	585 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM2	Q99965	735 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQY0	241 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC160	A6NGH7	325 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		I3L4J1	428 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3R2	O00459	728 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	LRCH4	O75427	683 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC130	P13994	396 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GPD1	P21695	349 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ADORA2B	P29275	332 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	BCAT1	P54687	386 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZNX1	250 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PCGF5	Q86SE9	256 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RNF169	Q8NCN4	708 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SENP8	Q96LD8	212 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	RSAD1	Q9HA92	442 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		15.7	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPM1	405 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	MATN2	O00339	956 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	SUPT3H	O75486	399 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	OR6B1	O95007	311 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	KRT7	P08729	469 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	CKB	P12277	381 aa		15.69	■□□□□ 0.1
BBS1-225	ENST00000630659	GALK1	P51570	392 aa		15.69	■□□□□ 0.1

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