RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DNM3Q9UQ16 869 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 STK38LQ9Y2H1 464 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SBNO1A3KN83 1393 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K5Q99683 1374 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087WV62 115 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GWJ7 208 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPL8 197 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRX2 142 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 WDR91A4D1P6 747 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A6NNZ2 444 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TISP43B9A030 160 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 B9A039 149 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8TH3BQL2 631 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 H3BQV1 296 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NPC1O15118 1278 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BUB1O43683 1085 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ADCY3O60266 1144 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DLX3O60479 287 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PEX11AO75192 247 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TACC1O75410 805 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CLN5O75503 358 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PENKP01210 267 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IFNB1P01574 187 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SOD2P04179 222 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RB1P06400 928 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RETP07949 1114 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 QDPRP09417 244 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FAM153BP0C7A2 387 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MYL4P12829 197 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 KCNA5P22460 613 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CDC25CP30307 473 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ADSSP30520 456 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HTR2BP41595 481 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GRIA2P42262 883 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CPT1AP50416 773 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 STAT5BP51692 787 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 THOP1P52888 689 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R2AP63151 447 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ARF5P84085 180 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RALGDSQ12967 914 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PLD1Q13393 1074 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RIPK1Q13546 671 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 PLS1Q14651 629 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM240Q5SV17 173 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 WLSQ5T9L3 541 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D9BQ66K14 1250 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM160B2Q86V87 743 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 SUCLG2Q96I99 432 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 C7orf34Q96L11 122 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CEP19Q96LK0 163 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AK8Q96MA6 479 aa3.18□□□□□ -1.9
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