RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561077.1

CCNB2-204, Transcript of cyclin B2, human

TSL 5

Gene CCNB2, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB2-204	ENST00000561077	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SCML2	Q9UQR0	700 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	KALRN	O60229	2985 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	HHLA1	C9JL84	531 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CBX4	O00257	560 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	MDM4	O15151	490 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	VILL	O15195	856 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CYP26A1	O43174	497 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	BRINP1	O60477	761 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	KLKB1	P03952	638 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TNNI1	P19237	187 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CHKA	P35790	457 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CXADR	P78310	365 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TMEM245	Q9H330	911 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CLMP	Q9H6B4	373 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	NMUR1	Q9HB89	426 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	EXOC3	O60645	756 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	IGHV4-34	P06331	123 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RARG	P13631	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CCDC130	P13994	396 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ACTN2	P35609	894 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	BCAT1	P54687	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RHD	Q02161	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ZBTB16	Q05516	673 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	DPYD	Q12882	1025 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SHB	Q15464	509 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ACOT1	Q86TX2	421 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CPXM2	Q8N436	756 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SAP25	Q8TEE9	199 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	FBRS	Q9HAH7	460 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	SGK2	Q9HBY8	427 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	MAST4	O15021	2626 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077		A0A1W2PPC4	97 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077		A0A1W2PQH9	124 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	C10orf142	B7Z368	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077		B8ZZF3	427 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	PDXK	O00764	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	YKT6	O15498	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TIMM44	O43615	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	FSBP	O95073	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	WNT1	P04628	370 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	MAP2K3	P46734	347 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	PDE4C	Q08493	712 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	ILK	Q13418	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TRPC3	Q13507	836 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	PNOC	Q13519	176 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CCNB2-204	ENST00000561077	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

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