RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555506.1

KTN1-222, Transcript of kinectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene KTN1, Length 1,464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-222	ENST00000555506	MT-CO3	P00414	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	DRD4	P21917	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PRKCH	P24723	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NDUFS1	P28331	727 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	STAT6	P42226	847 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SLC37A1	P57057	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	DCAF7	P61962	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GAB1	Q13480	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CNGA3	Q16281	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GPR162	Q16538	588 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506		H3BNC9	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CLIC1	O00299	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PRY	O14603	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	F9	P00740	461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	LYL1	P12980	280 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PRPH2	P23942	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GGT5	P36269	586 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GPD2	P43304	727 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CCR9	P51686	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	MVD	P53602	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CYP4F2	P78329	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CD180	Q99467	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	EXOC3	O60645	756 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	AVPR2	P30518	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	HOXD12	P35452	270 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	KRT32	Q14532	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	KCNB1	Q14721	858 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SEC23B	Q15437	767 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	GPR78	Q96P69	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	MROH8	Q9H579	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTN1-222	ENST00000555506	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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