RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		H3BNC9	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CPA1	P15085	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CHN1	P15882	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	AGTR2	P50052	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CCR5	P51681	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GAB1	Q13480	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KCNB1	Q14721	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RALBP1	Q15311	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PRY	O14603	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ADAM10	O14672	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TSPAN3	O60637	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KAT7	O95251	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CSF1	P09603	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CYP3A7	P24462	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	NDUFS1	P28331	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	STAT6	P42226	847 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	VPS41	P49754	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MAPK7	Q13164	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CLPB	Q9H078	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		J3KRW8	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GRM8	O00222	908 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KLK10	O43240	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MOSPD3	O75425	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ACP5	P13686	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	IGFBP2	P18065	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HOXD12	P35452	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DDIT3	P35638	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PNPLA4	P41247	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC37A1	P57057	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	YPEL5	P62699	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	VAMP2	P63027	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CFHR1	Q03591	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CDK18	Q07002	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HTRA1	Q92743	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	STAM	Q92783	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GPR78	Q96P69	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	NPAS1	Q99742	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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