RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DYRK4Q9NR20 520 aa5.79□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 COX16Q9P0S2 106 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 STIM2Q9P246 746 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.79□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.78□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 CER1O95813 267 aa5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV3-25P01717 112 aa5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 CFIP05156 583 aa5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 RHOCP08134 193 aa5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 MMEP08473 750 aa5.77□□□□□ -1.49
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