RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TRIM66O15016 1216 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TBC1D4O60343 1298 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SEC24AO95486 1093 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CSH1P0DML2 217 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CSH2P0DML3 217 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PHBP35232 272 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SLC1A5Q15758 541 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 APBB2Q92870 758 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 C8orf48Q96LL4 319 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 RRN3Q9NYV6 651 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SLC12A8A0AV02 714 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 HACD1B0YJ81 288 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FAM107AO95990 144 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TBX4P57082 545 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 IKBKEQ14164 716 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SERAC1Q96JX3 654 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GGT7Q9UJ14 662 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CEP290O15078 2479 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 COL6A1P12109 1028 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MAGEA3P43357 314 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 IGSF8Q969P0 613 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 E2F8A0AVK6 867 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ATP9BO43861 1147 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GJB5O95377 273 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 DRD4P21917 467 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CA4P22748 312 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CA8P35219 290 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ABCG1P45844 678 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 AIF1P55008 147 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GALNT2Q10471 571 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CROCCP2Q86T23 111 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 IGSF21Q96ID5 467 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 WBP1LQ9NX94 342 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OR6C75A6NL08 312 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OPHN1O60890 802 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FOXN2P32314 431 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MAGEA6P43360 314 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SCML4Q8N228 414 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MZB1Q8WU39 189 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ATP2A3Q93084 1043 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CYTH2Q99418 400 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TLR5O60602 858 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GJB3O75712 270 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MAXP61244 160 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PPP2R5DQ14738 602 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 HDAC11Q96DB2 347 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ZNF333Q96JL9 665 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ZNF778Q96MU6 729 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SERPINB11Q96P15 392 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 COL4A6Q14031 1691 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TPSB2P20231 275 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ATP5DP30049 168 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 STX2P32856 288 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms