RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	IQCB1	Q15051	598 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	VPS16	Q9H269	839 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266		M0QZQ0	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PMM2	O15305	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	AP5Z1	O43299	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CXCL14	O95715	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LRG1	P02750	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	JMJD7	P0C870	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CTSA	P10619	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TNNT1	P13805	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CD58	P19256	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TYMP	P19971	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KLRC2	P26717	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PCSK1	P29120	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	STAT5A	P42229	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LIMS1	P48059	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LHX1	P48742	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NDUFV1	P49821	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ARPP19	P56211	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UBASH3A	P57075	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CBX1	P83916	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TSPY1	Q01534	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DSG1	Q02413	1049 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LRMP	Q12912	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CUL2	Q13617	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF460	Q14592	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SSPN	Q14714	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PSMD5	Q16401	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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