RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532581.5

GRAMD1B-208, Transcript of GRAM domain containing 1B, human

TSL 2

Gene GRAMD1B, Length 2,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MED21	Q13503	144 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DCX	O43602	365 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HCRT	O43612	131 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PEX1	O43933	1283 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DAB1	O75553	588 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HSPA4L	O95757	839 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MPO	P05164	745 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PEX2	P28328	305 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NUMB	P49757	651 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RAB27A	P51159	221 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MTTP	P55157	894 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581		Q3C1V9	767 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RAG1	P15918	1043 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SERPINB6	P35237	376 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	AQP4	P55087	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KLF10	Q13118	480 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GRM2	Q14416	872 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MROH8	Q9H579	483 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581		G3V2L1	256 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZBTB14	O43829	449 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	AP1G2	O75843	785 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRT34	O76011	436 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	USP4	Q13107	963 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DPYS	Q14117	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NME8	Q8N427	588 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NCSTN	Q92542	709 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581		H3BNX3	289 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GSTT1	P30711	240 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GMPR	P36959	345 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRIP10	Q15642	601 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM135	Q86UB9	458 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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