RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 STILQ15468 1287 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARRDC3Q96B67 414 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 C1orf74Q96LT6 269 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 NEK1Q96PY6 1258 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 NDC1Q9BTX1 674 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP22Q9UPT9 525 aa5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SYCE3A1L190 88 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM170BA6NMN3 283 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF103O00237 685 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 LIASO43766 372 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CBFA2T3O75081 653 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 COX7A2P14406 83 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PNLIPP16233 465 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SDHBP21912 280 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 KELP23276 732 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPD2P43304 727 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 STAT5BP51692 787 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 NME5P56597 212 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TIRAPP58753 221 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRAMEP78395 509 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 LMAN2Q12907 356 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RUNX2Q13950 521 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 AACSQ86V21 672 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOOK3Q86VS8 718 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ABCG8Q9H221 673 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 APPL1Q9UKG1 709 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RTN2O75298 545 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 DDAH2O95865 285 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CFIP05156 583 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM11P17152 192 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPA1P27694 616 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMOD1P28289 359 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADRA1BP35368 520 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 THBS4P35443 961 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 VIPR2P41587 438 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF81P51508 661 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPATQ06203 517 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CST9LP1Q5W188 147 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 NETO2Q8NC67 525 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 ST7LQ8TDW4 575 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 MYRFLQ96LU7 910 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CD180Q99467 661 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP41Q9BYV8 373 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 MPP6Q9NZW5 540 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 HESX1Q9UBX0 185 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.78□□□□□ -1.48
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.77□□□□□ -1.49
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM25EA8MYX2 175 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms