RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	BRAP	Q7Z569	592 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SFR1	Q86XK3	245 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CHPF	Q8IZ52	775 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	RLN3	Q8WXF3	142 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	RAD54L	Q92698	747 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	HPDL	Q96IR7	371 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	FNBP1	Q96RU3	617 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	GCNT4	Q9P109	453 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SCN1A	P35498	2009 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	OBSL1	O75147	1896 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LAMA1	P25391	3075 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TSC2	P49815	1807 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MEI4	A8MW99	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388		A8MXQ7	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388		F8VP50	259 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SGK1	O00141	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	GABRD	O14764	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TADA3	O75528	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LRIG2	O94898	1065 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CER1	O95813	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	P4HA1	P13674	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TNNI1	P19237	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	KDSR	Q06136	332 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TAF10	Q12962	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TRPC3	Q13507	836 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	DEFB119	Q8N690	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CDC6	Q99741	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1B0GTW7	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms