RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EPN3	Q9H201	632 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TREM1	Q9NP99	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	WWOX	Q9NZC7	414 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		3.34	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PN81	502 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ATP8B1	O43520	1251 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MED24	O75448	989 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SPDEF	O95238	335 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	METTL18	O95568	372 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ONECUT2	O95948	504 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OTC	P00480	354 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CSTA	P01040	98 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ALPP	P05187	535 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ITGAV	P06756	1048 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TUBB	P07437	444 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ALPPL2	P10696	532 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CHRNA7	P36544	502 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LSS	P48449	732 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DGKE	P52429	567 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	YPEL5	P62699	121 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ENPEP	Q07075	957 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LMAN2	Q12907	356 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	EPS8	Q12929	822 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RAPSN	Q13702	412 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IRF3	Q14653	427 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MORF4L2	Q15014	288 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CHRNA6	Q15825	494 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	UGP2	Q16851	508 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TTC22	Q5TAA0	569 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLC15A4	Q8N697	577 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GPR156	Q8NFN8	814 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR8K5	Q8NH50	307 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ST7L	Q8TDW4	575 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF384	Q8TF68	577 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	THRSP	Q92748	146 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KAT2A	Q92830	837 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RMDN1	Q96DB5	314 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RAD9A	Q99638	391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MIPEP	Q99797	713 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CABP5	Q9NP86	173 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88	3e-7	■■■■□ 21.3
TTC3-214	ENST00000472398	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SBNO1	A3KN83	1393 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ADCY9	O60503	1353 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SYCE3	A1L190	88 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC154	A6NI56	674 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398		E7ENQ6	273 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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