RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TSHR	P16473	764 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RBBP4	Q09028	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A088AWK7	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNH1	O95259	989 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CHRNG	P07510	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNJ1	P48048	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	GPR15	P49685	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	GPSM2	P81274	684 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PKN1	Q16512	942 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285		F5H5T6	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TMCC2	O75069	709 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CASP5	P51878	434 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ADSS	P30520	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FBXO21	O94952	628 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBA1B	P68363	451 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TNK2	Q07912	1038 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23	4e-7	■■■■■ 120.8
NCOR2-208	ENST00000429285	POC5	Q8NA72	575 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PIF1	Q9H611	641 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PLOD3	O60568	738 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	IRF1	P10914	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	GLRB	P48167	497 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	IL2	P60568	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NEK3	P51956	506 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MED8	Q96G25	268 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	AFF2	P51816	1311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	HMBS	P08397	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC2A4	P14672	509 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	BIK	Q13323	160 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RGS14	O43566	566 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ETS1	P14921	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNQ3	O43525	872 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SCGN	O76038	276 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	LYN	P07948	512 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ARPC4	P59998	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	2e-6	■■■■■ 44.4
NCOR2-208	ENST00000429285	TDP2	O95551	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	GJD3	Q8N144	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DSE	Q9UL01	958 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PDIA6	Q15084	440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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