RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 PHF2O75151 1096 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF3B1-204ENST00000414963 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF3B1-204ENST00000414963 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF3B1-204ENST00000414963 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.65□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 IRF7Q92985 503 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF3B1-204ENST00000414963 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF3B1-204ENST00000414963 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SF3B1-204ENST00000414963 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF3B1-204ENST00000414963 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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SF3B1-204ENST00000414963 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 TTC16Q8NEE8 873 aa14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ATL2Q8NHH9 583 aa14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 HAUS1Q96CS2 278 aa14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 MAGEH1Q9H213 219 aa14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.63□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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