RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.08□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.08□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.08□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEPDC5O75140 1603 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM94Q12767 1356 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B5MCH6 92 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NKX2-8O15522 239 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEC14L2O76054 403 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STC2O76061 302 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUBBP07437 444 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCER1AP12319 257 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HK1P19367 917 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFKBIAP25963 317 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBL1P28749 1068 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GCH1P30793 250 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VIPR1P32241 457 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL13P35225 146 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PBX1P40424 430 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PBX3P40426 434 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD86P42081 329 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GATMP50440 423 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PGDP52209 483 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MVDP53602 400 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UFM1P61960 85 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMF1P82094 1093 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRT17Q04695 432 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IDI1Q13907 227 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNJ12Q14500 433 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 E2F5Q15329 346 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL35Q6PF15 583 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf88Q6PI97 169 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q6ZUG5 572 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DOK3Q7L591 496 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GGNQ86UU5 652 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MON1AQ86VX9 555 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC30AQ86WT1 665 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTLL6Q8N841 843 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPB3Q92617 1050 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNFT2Q96EX2 444 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPAG5Q96R06 1193 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIGSQ96S52 555 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HAPLN3Q96S86 360 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABHD1Q96SE0 405 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MROH8Q9H579 483 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VEZTQ9HBM0 779 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SELENONQ9NZV5 590 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BAG5Q9UL15 447 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMCC3Q9ULS5 477 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MROH1Q8NDA8 1641 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABCC5O15440 1437 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF15Q9NS87 1388 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR14I1A6ND48 311 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AGAP5A6NIR3 686 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GLOD5A6NK44 160 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGS10O43665 173 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPARCP09486 303 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WEE2P0C1S8 567 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNNT1P13805 278 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COX7A2P14406 83 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARSAP15289 507 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AVPR2P30518 371 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXC8P31273 242 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms