RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365553.1

RNU6-827P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 827, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-827P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-827P-201ENST00000365553 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 AGAP5A6NIR3 686 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 E7EVH7 732 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KIR2DS3K7RE56 304 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SOCS2O14508 198 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 UGDHO60701 494 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 NBNO60934 754 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 DHRS4L1P0CG22 281 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SHC2P98077 582 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 LAMB3Q13751 1172 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 DCTN1Q14203 1278 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 POSTNQ15063 836 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RRAGAQ7L523 313 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KLBQ86Z14 1044 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SLC44A5Q8NCS7 719 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SPPL3Q8TCT6 385 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 GOLGA1Q92805 767 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HMCESQ96FZ2 354 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF778Q96MU6 729 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PSMD1Q99460 953 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM167BQ9BTA0 163 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TWSG1Q9GZX9 223 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 LZTS1Q9Y250 596 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 DTX4Q9Y2E6 619 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TMEM247A6NEH6 219 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KCNJ18B7U540 433 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 GRM8O00222 908 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ADAM10O14672 748 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 NFATC1O95644 943 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HLA-DQA2P01906 255 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TK1P04183 234 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TNNT1P13805 278 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ME1P48163 572 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ACTR2P61160 394 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CDK18Q07002 472 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 EFR3AQ14156 821 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 GALNT3Q14435 633 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PGM5Q15124 567 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RABEP1Q15276 862 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MIDNQ504T8 468 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TTC39AQ5SRH9 613 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CYB5R4Q7L1T6 521 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RTL10Q7L3V2 364 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MDGA2Q7Z553 956 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TMEM57Q8N5G2 664 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 EXD3Q8N9H8 876 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MORC4Q8TE76 937 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ARRDC3Q96B67 414 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TASP1Q9H6P5 420 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RASSF1Q9NS23 344 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ELOVL5Q9NYP7 299 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RNF7Q9UBF6 113 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SLC25A13Q9UJS0 675 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KCND3Q9UK17 655 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PKP3Q9Y446 797 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF521Q96K83 1311 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 SAC3D1A6NKF1 404 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 RHODO00212 210 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 MSI1O43347 362 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 TULP3O75386 442 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 KRT38O76015 456 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PEPDP12955 493 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PRF1P14222 555 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-827P-201ENST00000365553 CHN1P15882 459 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms