RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297533.8

TMUB1-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB1, Length 1,353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1-201ENST00000297533 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.93■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 RPS14P62263 151 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ECT2LQ008S8 904 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 FBXL22Q6P050 247 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 FAM124AQ86V42 546 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 XYLT1Q86Y38 959 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SCML1Q9UN30 329 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 METTL12A8MUP2 240 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ARHGAP33O14559 1287 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 GFPT2O94808 682 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 F9P00740 461 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 MMEP08473 750 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NNMTP40261 264 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SULT1E1P49888 294 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SULT2A1Q06520 285 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 HDDC3Q8N4P3 179 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SPAG5Q96R06 1193 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 A0A1B0GTW7 788 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SIN3BO75182 1162 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PAGE1O75459 146 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PDGFRAP16234 1089 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 MAOBP27338 520 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SOX5P35711 763 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 KLK7P49862 253 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NOMO3P69849 1222 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 APCDD1Q8J025 514 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NT5C3BQ969T7 300 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 BTBD1Q9H0C5 482 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 WDCPQ9H6R7 721 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PIGVQ9NUD9 493 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.91■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 LGALS16A8MUM7 142 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CXCR3P49682 368 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 PLK1P53350 603 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 JAM2P57087 298 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CDR2Q01850 454 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CENPCQ03188 943 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 DEUP1Q05D60 604 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NAA35Q5VZE5 725 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 MTG2Q9H4K7 406 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB1-201ENST00000297533 CACNA1EQ15878 2313 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 OPHN1O60890 802 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 CLDN11O75508 207 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 SEMA4FO95754 770 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 CEACAM1P13688 526 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 ACSL1P33121 698 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 STAT1P42224 750 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 SYCP1Q15431 976 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 USP30Q70CQ3 517 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 NEK11Q8NG66 645 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.89■■□□□ 1.41
TMUB1-201ENST00000297533 IGSF8Q969P0 613 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms