RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF25Q9BQ70 676 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 IL21Q9HBE4 155 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MAFFQ9ULX9 164 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 IRAK3Q9Y616 596 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 WASH4PA8MWX3 477 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 AVILO75366 819 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTN5O94779 1100 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CSPG5O95196 566 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 APRTP07741 180 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN3P26045 913 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CA8P35219 290 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CTNNB1P35222 781 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CREMQ03060 361 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF534Q76KX8 674 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GBF1Q92538 1859 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAPO00193 183 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 F11P03951 625 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 KLKB1P03952 638 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB17Q13105 803 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA5AQ13591 1074 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMK1Q14012 370 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 VEPH1Q14D04 833 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C4orf22Q6V702 233 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPUQ71F23 418 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB12Q96P63 405 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GKN1Q9NS71 199 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CLUHO75153 1309 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 F5H423 210 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 OPHN1O60890 802 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MX2P20592 715 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIA1P42261 906 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHB3P54753 998 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CBLBQ13191 982 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 WBP2Q969T9 261 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A12Q96S37 553 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC3Q9BY71 257 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 LZTS1Q9Y250 596 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 DRGXA6NNA5 263 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAFKO60675 156 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MYZAPP0CAP1 466 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A4P31645 630 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL4CP56559 192 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GPX6P59796 221 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF12Q16514 161 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 POF1BQ8WVV4 589 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 STC2O76061 302 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMB4P28070 264 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA3P43357 314 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZXDBP98169 803 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT71Q3SY84 523 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GAREM2Q75VX8 874 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LZTR1Q8N653 840 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TSGA13Q96PP4 275 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms