RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.49■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.49■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.49■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRRT4C9JH25 899 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 K7EQS6 105 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 PI15O43692 258 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 TNNT1P13805 278 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMAN2Q12907 356 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 DPYSL2Q16555 572 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 GGA2Q9UJY4 613 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT86O43790 486 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 GOT1P17174 413 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUMBP49757 651 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 TPI1P60174 286 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMLNQ96KR4 655 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.48■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0A0MRY4 1105 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT7P08729 469 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXC13P31276 330 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEC13P55735 322 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 NLRP14Q86W24 1093 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 NDFIP2Q9NV92 336 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.47■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 RHOQP17081 205 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 AOC1P19801 751 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR1E1P30953 314 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDH6P55285 790 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 EMC10Q5UCC4 262 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM215Q68D42 235 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 Q6ZS52 159 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.46■■□□□ 1.35
SIGMAR1-201ENST00000277010 NCAM2O15394 837 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF40O75150 1001 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 PALMO75781 387 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CD48P09326 243 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CSKP41240 450 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC32Q14392 662 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT81Q14533 505 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 RFX8Q6ZV50 586 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 FBXL6Q8N531 539 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CIPCQ9C0C6 399 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 DNAI1Q9UI46 699 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.45■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 DAPK3O43293 454 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 RHOCP08134 193 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 HTR7P34969 479 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARL4AP40617 200 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 TNFRSF4P43489 277 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARSEP51690 589 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLCN5P51795 746 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 FUT11Q495W5 492 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 FBXO43Q4G163 708 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC38Q5VT99 294 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 APCDD1Q8J025 514 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 AHI1Q8N157 1196 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 KCTD6Q8NC69 237 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLDN23Q96B33 292 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 H3BRJ5 948 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 C2orf27AQ580R0 203 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.44■■□□□ 1.34
SIGMAR1-201ENST00000277010 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms