RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 FAM228AQ86W67 206 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PNKPQ96T60 521 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 COQ7Q99807 217 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ADI1Q9BV57 179 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SGTAO43765 313 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PDE5AO76074 875 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CYP1A2P05177 515 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SERPINA4P29622 427 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC12A3P55017 1021 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NR6A1Q15406 480 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM187BQ17R55 369 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PCID2Q5JVF3 399 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ILDR2Q71H61 639 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 IL22Q9GZX6 179 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HAO1Q9UJM8 370 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 WDR27A2RRH5 827 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 H3BRB1 525 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TNFAIP8O95379 198 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 JCHAINP01591 159 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SHMT1P34896 483 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NEK3P51956 506 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ADIGQ0VDE8 80 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GRM3Q14832 879 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAXCQ5TGI0 409 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MIB1Q86YT6 1006 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SGF29Q96ES7 293 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FUT8Q9BYC5 575 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SNX6Q9UNH7 406 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 C3P01024 1663 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1G2O95670 118 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF24P17028 368 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 YY1P25490 414 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MMP13P45452 471 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TUBP50607 506 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CLCN5P51795 746 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ST3GAL1Q11201 340 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DGUOKQ16854 277 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ACER1Q8TDN7 264 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MTERF3Q96E29 417 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PGM2Q96G03 612 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ACOX2Q99424 681 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CDH9Q9ULB4 789 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 AKAP3O75969 853 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KRT34O76011 436 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF286BP0CG31 522 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 OR1E1P30953 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CASP4P49662 377 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GPR15P49685 360 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCR3P51677 355 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SMIM11AP58511 58 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 XRCC4Q13426 336 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MDM1Q8TC05 714 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BTBD7Q9P203 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms